Deltacron

Qu'est-ce que Deltacron ?

Comme le suggère le mot-valise, Deltacron est un variant de la Covid qui contient des éléments de Delta et d’Omicron – en d’autres termes, il contient des gènes des deux variants, ce qui en fait ce que l’on appelle un virus recombinant.

« Ces recombinants apparaissent lorsque plusieurs variants infectent et se répliquent chez la même personne, dans les mêmes cellules », explique le professeur Lawrence Young, virologue à l'Université de Warwick. « Deltacron est un produit des variants Delta et Omicron circulant dans la même population. »

Cette semaine, Gisaid, une communauté mondiale de scientifiques qui partage des informations sur le virus, a publié que la première preuve solide de cette variante avait été partagée par l'Institut Pasteur en France.

Où cette variante a-t-elle été trouvée ?

Gisaid indique que le variant a été identifié dans plusieurs régions de France et semble circuler depuis le début de l'année. « Des génomes présentant un profil similaire ont également été identifiés au Danemark et aux Pays-Bas », précise Gisaid.

Des cas de Deltacron ont également été signalés aux États-Unis, et une trentaine de cas ont été détectés au Royaume-Uni, selon l'Agence britannique de sécurité sanitaire (UKHSA). Le journal i a indiqué que les premiers cas de transmission interhumaine de Deltacron au Royaume-Uni devraient être confirmés cette semaine.

Le Dr Etienne Simon-Lorière de l'Institut Pasteur a averti qu'il pourrait y avoir plusieurs virus recombinants différents formés à partir de Delta et d'Omicron.

« Celui que nous observons en France et au Danemark/Pays-Bas est très similaire et pourrait être le même recombinant (avec les mêmes virus parentaux) qui a voyagé », a-t-il déclaré. Mais, a-t-il ajouté, les recombinants Delta-Omicron possibles signalés dans des pays comme le Royaume-Uni et les États-Unis semblent combiner différents fragments de leurs virus parentaux et diffèrent donc du Deltacron observé en France.

« Nous devrons peut-être trouver un nom différent pour désigner ces recombinants, ou commencer à ajouter un numéro », a-t-il déclaré.

Dans quelle mesure devrions-nous nous inquiéter ?

Les experts ont rapidement souligné que les variantes recombinantes ne sont pas rares et que Deltacron n’est pas le premier et ne sera pas le dernier à se produire pour le Covid.

« Cela se produit chaque fois que nous sommes dans la période de transition d'une variante dominante à une autre, et c'est généralement une curiosité scientifique, mais pas beaucoup plus que cela », explique le Dr Jeffrey Barrett, qui a précédemment dirigé l'initiative de génomique Covid-19 au Wellcome Trust Sanger Institute.

Cependant, avec seulement un petit nombre de cas de Deltacron identifiés jusqu'à présent, il n'existe pas encore suffisamment de données sur la gravité du variant ou sur l'efficacité des vaccins contre celui-ci.

Soumya Swaminathan, scientifique en chef de l'Organisation mondiale de la Santé, a tweeté mardi : « Nous savons que des événements recombinants peuvent survenir, chez l'homme ou l'animal, avec de multiples variants circulants du #SarsCoV2. Il est nécessaire d'attendre des expériences pour déterminer les propriétés de ce virus. Le séquençage, l'analyse et le partage rapide des données sont essentiels pour faire face à cette pandémie. »

Young partage cet avis. « Nous devons surveiller le comportement de ce recombinant, notamment sa transmissibilité et sa capacité à échapper à la protection immunitaire induite par le vaccin », explique-t-il. « Cela renforce également la nécessité de maintenir une surveillance génétique. À mesure que le virus continue de circuler, en particulier dans les populations sous-vaccinées et chez les personnes dont l'immunité induite par le vaccin s'affaiblit, nous sommes très susceptibles d'observer davantage de variants, y compris ceux générés par recombinaison. »

Mais cela ne signifie pas que le variant soit une raison de paniquer : selon l’UKHSA, le variant ne présente pas un taux de croissance préoccupant.

« Ce phénomène a été observé quelques fois au Royaume-Uni et, jusqu'à présent, il semble très rare dans le monde, avec seulement quelques dizaines de séquences parmi les millions d'Omicrons », explique Barrett. « Je ne pense donc pas qu'il y ait lieu de s'inquiéter pour le moment, même si je suis sûr que la surveillance continuera. »

Les vagues précédentes de Delta et d’Omicron, ainsi que les vaccinations, signifient qu’il est probable qu’il y ait au moins une certaine protection contre cette variante.